My publications
- Burkov B., Nagaev B., Spirin S, Alexeevski A.
“MALAKITE: AN AUTOMATIC TOOL FOR CHARACTERISATION OF STRUCTURE OF
RELIABLE BLOCKS IN MULTIPLE ALIGNMENTS OF PROTEIN SEQUENCES”,
JBCB, 2010;
abstract,
full text
- постерный доклад в конференции Ломоносов
“3D structure based protein alignment check”, 2010;
- постерный доклад в конференции Ломоносов
“3D structure based check of Pfam alignments”, 2011;
- постерный доклад в конференции RECESS
“3D structure based check of Pfam alignments”,
Мюнхен, 2011;
- постерный доклад в конференции Ломоносов
“Семейство мер качества выравниваний,
основанных на количестве ошибок в колонках
в сравнении с эталонным выравниванием”, 2012;
- постерный доклад в конференции RECESS
“Algorithms for comparison of closely related bacterial genomes”
(Алгоритмы сравнения близкородственных бактериальных геномов),
Москва, 22 июня 2012;
- постерный доклад в конференции RECESS
“The algorithm for comparison of closely related bacterial genomes”
(Алгоритмы сравнения близкородственных бактериальных геномов),
Мюнхен, 20 января 2013;
- постерный доклад в конференции RECESS
“The algorithm for comparison of closely related bacterial genomes”
(Алгоритмы сравнения близкородственных бактериальных геномов),
Венеция, 23 мая 2013.
- постерный доклад в
конференции ECCB’14
“NPG-explorer: a new tool for nucleotide pangenome construction and
analysis of closely related prokaryotic genomes”
(NPG-explorer: новая программа для создания нуклеотидного пангенома
и анализа близкородственных геномов прокариот),
Страсбург, сентябрь 2014
- соавтор доклада “Компьютерная контркриминалистика в NIX-системах”
Докладчик: Ярослав Шмелев.
Научный руководитель: Борис Эдуардович Нагаев.
PHDays Young School 2015, 28 мая 2015.
- poster paper at Moscow Conference on Computational Molecular
Biology (MCCMB’15)
“NPG-explorer, a tool for creating and
exploring nucleotide pangenome for closely related
prokaryotic genomes”. July, 16, 2015
- report at Moscow Conference on Computational Molecular
Biology (MCCMB’15)
“NPG-explorer: a new tool for nucleotide pangenome
construction and analysis of closely related prokaryotic
genomes”. July, 17, 2015
- D.V. Goryunov, B.E. Nagaev, M.Yu Nikolaev, A.V. Alexeevski, and A.V. Troitsky.
Moss phylogeny reconstruction using nucleotide pangenome of
complete mitogenome sequences.
Biochemistry (Moscow), 80(11):1522–1527, 2015.
See also my posts on Habrahabr.
