Нагаев Борис, 301 группа

5' GAATTCGGATCCAAGCATGCTCCATGGTTAAGCTTGGTACC 3'
3' CTTAAGCCTAGGTTCGTACGAGGTACCAATTCGAACCATGG 5'

обратная последовательность: 
5' GGTACCAAGCTTAACCATGGAGCATGCTTGGATCCGAATTC 3'

EcoRI     GAATTC, G'AATTC
BamHI     GGATCC, G'GATCC
SphI      GCATGC, GCATG'C
NcoI      CCATGG, C'CATGG
HindIII   AAGCTT, A'AGCTT
KpnI      GGTACC, GGTAC'C
   
   EcoRI  BamHI    SphI    NcoI     HindIIIKpnI
5' G'AATTCG'GATCCAAG'CATGCTC'CATGGTTA'AGCTTGGTAC'C 3'

                               ген X
...AAAAAATTCTTGATCCAGGAGGTAACC ATG CCA TAT CAC.... 
....... CCA TAG AGACTTACAAAAAAGCTTCAAGGCT...




A
    Места, по которым режут BamHI и BglII:
        5 GCATGCGAG'GATCCACTA'GATCT 3
        3 CGTACGCTCCTAG'GTGATCTAG'A 5

    После BamHI и BglII:
        5 GCATGCGAG      GATCCACTA      GATCT 3
        3 CGTACGCTCCTAG      GTGATCTAG      A 5
    
    После отделения от коротких фрагментов ДНК:
        5 GCATGCGAG         GATCT 3
        3 CGTACGCTCCTAG         A 5

    После ДНК-лигазы T4 (Ответ задачи):
        5 GCATGCGAGGATCT 3
        3 CGTACGCTCCTAGA 5

B
    После BamHI и BglII:
        5 GCATGCGAG      GATCCACTA      GATCT 3
        3 CGTACGCTCCTAG      GTGATCTAG      A 5
    
    После ФК + смесь dNTP:
        5 GCATGCGAGGATC  GATCCACTAGATC  GATCT 3
        3 CGTACGCTCCTAG  CTAGGTGATCTAG  CTAGA 5

    После отделения от коротких фрагментов ДНК:
        5 GCATGCGAGGATC  GATCT 3
        3 CGTACGCTCCTAG  CTAGA 5

    После ДНК-лигазы T4 (Ответ задачи):
        5 GCATGCGAGGATCGATCT 3
        3 CGTACGCTCCTAGCTAGA 5

С
    После BamHI и BglII:
        5 GCATGCGAG      GATCCACTA      GATCT 3
        3 CGTACGCTCCTAG      GTGATCTAG      A 5

    После нуклеазы S1:
        5 GCATGCGAG          CACTA          T 3
        3 CGTACGCTC          GTGAT          A 5

    После отделения от коротких фрагментов ДНК:
        5 GCATGCGAG                         T 3
        3 CGTACGCTC                         A 5

    После ДНК-лигазы T4 (Ответ задачи):
        5 GCATGCGAGT 3
        3 CGTACGCTCA 5

D
    Места, по которым режет BamHI:
        5 GCATGCGAG'GATCCACTAGATCT 3
        3 CGTACGCTCCTAG'GTGATCTAGA 5
    
    После BamHI:
        5 GCATGCGAG       GATCCACTAGATCT 3
        3 CGTACGCTCCTAG       GTGATCTAGA 5

    После ФК + смесь dNTP:
        5 GCATGCGAGGATC   GATCCACTAGATCT 3
        3 CGTACGCTCCTAG   CTAGGTGATCTAGA 5

    Места, по которым режет BglII:
        5 GCATGCGAGGATC   GATCCACTA'GATCT 3
        3 CGTACGCTCCTAG   CTAGGTGATCTAG'A 5

    После BglII:
        5 GCATGCGAGGATC   GATCCACTA      GATCT 3
        3 CGTACGCTCCTAG   CTAGGTGATCTAG      A 5

    После нуклеазы S1:
        5 GCATGCGAGGATC   GATCCACTA          T 3
        3 CGTACGCTCCTAG   CTAGGTGAT          A 5

    После отделения от коротких фрагментов ДНК:
        5 GCATGCGAGGATC                      T 3
        3 CGTACGCTCCTAG                      A 5

    После ДНК-лигазы T4 (Ответ задачи):
        5 GCATGCGAGGATCT 3
        3 CGTACGCTCCTAGA 5

E
    Места, по которым режут SphI и BamHI:
        5 GCATG'CGAG'GATCCACTAGATCT 3
        3 C'GTACGCTCCTAG'GTGATCTAGA 5

    После SphI и BamHI:
        5 GCATG      CGAG        GATCCACTAGATCT 3
        3 C      GTACGCTCCTAG        GTGATCTAGA 5

    После ФК + смесь dNTP:
        5 GCATG      CGAGGATC    GATCCACTAGATCT 3
        3 C      GTACGCTCCTAG    CTAGGTGATCTAGA 5

    После ДНК-полимеразы T4 + смесь dNTP:
        5 G          CGAGGATC    GATCCACTAGATCT 3
        3 C          GCTCCTAG    CTAGGTGATCTAGA 5

    После отделения от коротких фрагментов ДНК:
        5 G                      GATCCACTAGATCT 3
        3 C                      CTAGGTGATCTAGA 5
        
    После ДНК-лигазы T4 (Ответ задачи):
        5 GGATCCACTAGATCT 3
        3 CCTAGGTGATCTAGA 5